Malakal liegt in der Sahelzone und weist dadurch ein heißes, semi-arides Klima mit wechselzeitigen Niederschlägen auf. Die Temperaturen sind ganzjährig sehr heiß.
Klimatabelle:
1961-1990:
Einzelnachweise:
- “Malakal Climate Normals 1961–1990”. National Oceanic and Atmospheric Administration. Retrieved January 24, 2015.