Junction liegt im westlichen Texas Hill Country auf ca. 500 m über den Meeresspiegel. Das Klima ist ein subtropisches Klima mit leichten kontinentalen Zügen. Aufgrund der Inlandlage sind die Temperaturunterschiede zwischen Tag und Nacht sehr hoch.
Klimatabelle:
1981-2010:

U.S. Climate Data (Temperaturen, Niederschlagsmenge, Schnee), NOAA (Niederschlagstage), Weather-Atlas (Sonnenstunden).