Das Klima in Flensburg wird von der südlichen Nordsee beeinflusst. Das Meer hat einen mildernden Effekt auf die Temperaturen, daher sind Extremtemperaturen äußerst selten. Flensburg gehört zu den nördlichsten Orten Deutschlands und weist ein gleiches Klima wie das dänische Jütland auf. Die Stadt gehört zu den Städten in Deutschland mit den meisten Niederschlagstagen im Jahr.
Klimatabelle: